随着南京地铁3号线通车日期越来越近，为确保开通后地铁票务系统设备稳定运行和票卡计费的准确性，南京地铁运营公司于2015年3月25日起，在1号线红山动物园站、小龙湾站，2号线经天路站，10号线中胜站、临江站，机场线正方中路站，宁天城际线泰冯路站进行单站费率测试。乘客从7个测试车站出站时，将按照3号线开通后的票价收费。
据了解，南京地铁目前是按照区间内最短里程进行计费，即当二个站点之间存在多条路径时，选择最短路径里程作为该区间的票价计算依据。以江心洲站至新街口站为例，如果在元通换乘2号线，即江心洲-元通-新街口，距离为14.879公里，高于10公里而低于16公里，票价应为3元；而如果在安德门换乘1号线，即江心洲-安德门-新街口，距离为16.480公里，高于16公里而低于22公里，票价应为4元。最终南京地铁线网站间距采用14.879公里作为计费依据。
据南京地铁前期公布的里程数据来看，因南京站-南京南站走3号线为15542米，比1号线南京站-南京南站17723米减少2181米，所以至1号线双龙大道、河定桥、天印大道、龙眠大道、S1线翠屏山、吉印大道距离缩短；又因南京站-大行宫走3号线为6577米，比走1、2号线7037米减少460米，至西安门、钟灵街、金马路距离也会缩短。届时，将有202个区间价格下调
在测试期间，部分乘客乘坐区间的票价将会降低，而从其它车站出站则不受任何影响。南京地铁运营公司提醒，乘客从7个测试车站进站至其它车站出站，乘客使用单程票出站或进行票卡更新时，仍执行现有票价不变。若乘客在此期间存在任何疑问，可拨打地铁服务热线（025-51899999）进行咨询或反映。